Naturstyrelsen har ca. 1.300 medarbejdere. De fleste er ansat på de lokale naturforvaltningsenheder rundt om i landet, mens cirka 300 medarbejdere er ansat i den centrale del af styrelsen i København.
Se organisationsdiagram (pdf)
Medarbejderne i Naturstyrelsen består af mange forskellige faggrupper: miljøteknikere, naturvejledere, skovfogeder, landskabsarkitekter, sagsbehandlere, jurister, kontorpersonale, skovarbejdere, vildtkonsulenter, biologer, webmedarbejdere, agronomer m.m.